Protein–RNA interactions for Protein: P49908

SELENOP, Selenoprotein P, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOPP49908 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENOPP49908 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SELENOPP49908 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms