Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFCP49767 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VEGFCP49767 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFCP49767 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms