Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSMB3P49720 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms