Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A6P48664 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A6P48664 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A6P48664 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A6P48664 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms