Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKI67P46013 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKI67P46013 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKI67P46013 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKI67P46013 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKI67P46013 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKI67P46013 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKI67P46013 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MKI67P46013 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKI67P46013 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MKI67P46013 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKI67P46013 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKI67P46013 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKI67P46013 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKI67P46013 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKI67P46013 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MKI67P46013 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MKI67P46013 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MKI67P46013 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MKI67P46013 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MKI67P46013 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MKI67P46013 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MKI67P46013 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MKI67P46013 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MKI67P46013 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MKI67P46013 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MKI67P46013 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MKI67P46013 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MKI67P46013 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MKI67P46013 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MKI67P46013 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MKI67P46013 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MKI67P46013 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MKI67P46013 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MKI67P46013 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MKI67P46013 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MKI67P46013 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MKI67P46013 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MKI67P46013 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MKI67P46013 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKI67P46013 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKI67P46013 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKI67P46013 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKI67P46013 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKI67P46013 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKI67P46013 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKI67P46013 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKI67P46013 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MKI67P46013 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKI67P46013 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKI67P46013 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MKI67P46013 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKI67P46013 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MKI67P46013 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MKI67P46013 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MKI67P46013 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MKI67P46013 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MKI67P46013 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MKI67P46013 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MKI67P46013 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MKI67P46013 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
MKI67P46013 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MKI67P46013 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MKI67P46013 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MKI67P46013 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKI67P46013 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKI67P46013 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKI67P46013 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MKI67P46013 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MKI67P46013 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MKI67P46013 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MKI67P46013 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MKI67P46013 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKI67P46013 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKI67P46013 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKI67P46013 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKI67P46013 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MKI67P46013 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MKI67P46013 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MKI67P46013 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MKI67P46013 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MKI67P46013 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MKI67P46013 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MKI67P46013 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MKI67P46013 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MKI67P46013 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MKI67P46013 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MKI67P46013 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MKI67P46013 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MKI67P46013 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MKI67P46013 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MKI67P46013 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MKI67P46013 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MKI67P46013 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MKI67P46013 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MKI67P46013 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MKI67P46013 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MKI67P46013 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MKI67P46013 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MKI67P46013 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms