Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNT3P45378 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNT3P45378 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms