Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFI27P40305 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFI27P40305 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFI27P40305 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFI27P40305 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFI27P40305 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFI27P40305 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFI27P40305 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFI27P40305 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFI27P40305 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFI27P40305 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFI27P40305 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFI27P40305 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFI27P40305 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFI27P40305 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFI27P40305 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFI27P40305 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFI27P40305 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFI27P40305 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFI27P40305 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFI27P40305 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFI27P40305 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFI27P40305 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFI27P40305 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFI27P40305 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFI27P40305 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFI27P40305 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFI27P40305 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFI27P40305 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFI27P40305 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFI27P40305 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFI27P40305 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFI27P40305 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFI27P40305 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFI27P40305 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFI27P40305 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFI27P40305 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFI27P40305 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFI27P40305 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFI27P40305 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFI27P40305 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFI27P40305 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFI27P40305 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFI27P40305 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFI27P40305 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFI27P40305 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFI27P40305 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFI27P40305 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFI27P40305 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFI27P40305 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFI27P40305 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFI27P40305 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFI27P40305 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFI27P40305 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFI27P40305 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFI27P40305 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFI27P40305 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFI27P40305 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFI27P40305 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFI27P40305 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFI27P40305 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFI27P40305 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFI27P40305 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFI27P40305 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFI27P40305 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFI27P40305 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFI27P40305 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFI27P40305 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IFI27P40305 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFI27P40305 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFI27P40305 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFI27P40305 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IFI27P40305 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFI27P40305 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFI27P40305 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFI27P40305 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFI27P40305 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFI27P40305 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFI27P40305 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFI27P40305 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFI27P40305 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFI27P40305 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI27P40305 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI27P40305 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI27P40305 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI27P40305 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI27P40305 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI27P40305 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFI27P40305 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI27P40305 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI27P40305 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI27P40305 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI27P40305 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI27P40305 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI27P40305 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFI27P40305 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFI27P40305 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFI27P40305 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFI27P40305 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFI27P40305 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms