Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYLC1P35663 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CYLC1P35663 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYLC1P35663 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYLC1P35663 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYLC1P35663 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms