Protein–RNA interactions for Protein: P35613

BSG, Basigin, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSGP35613 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BSGP35613 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BSGP35613 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BSGP35613 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BSGP35613 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BSGP35613 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BSGP35613 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BSGP35613 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BSGP35613 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BSGP35613 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BSGP35613 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BSGP35613 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BSGP35613 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BSGP35613 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BSGP35613 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSGP35613 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSGP35613 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSGP35613 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSGP35613 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSGP35613 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSGP35613 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSGP35613 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSGP35613 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSGP35613 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSGP35613 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BSGP35613 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BSGP35613 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BSGP35613 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BSGP35613 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BSGP35613 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BSGP35613 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BSGP35613 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BSGP35613 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BSGP35613 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BSGP35613 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BSGP35613 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BSGP35613 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BSGP35613 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BSGP35613 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BSGP35613 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BSGP35613 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BSGP35613 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BSGP35613 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BSGP35613 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BSGP35613 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BSGP35613 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BSGP35613 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BSGP35613 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BSGP35613 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BSGP35613 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BSGP35613 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BSGP35613 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BSGP35613 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BSGP35613 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BSGP35613 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BSGP35613 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BSGP35613 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BSGP35613 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BSGP35613 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BSGP35613 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BSGP35613 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BSGP35613 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BSGP35613 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BSGP35613 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BSGP35613 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BSGP35613 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BSGP35613 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BSGP35613 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BSGP35613 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BSGP35613 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BSGP35613 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BSGP35613 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BSGP35613 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BSGP35613 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BSGP35613 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BSGP35613 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BSGP35613 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BSGP35613 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BSGP35613 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BSGP35613 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BSGP35613 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BSGP35613 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BSGP35613 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BSGP35613 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BSGP35613 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BSGP35613 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BSGP35613 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BSGP35613 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BSGP35613 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BSGP35613 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BSGP35613 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BSGP35613 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BSGP35613 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BSGP35613 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BSGP35613 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BSGP35613 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BSGP35613 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BSGP35613 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BSGP35613 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BSGP35613 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms