Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLCN1P35523 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLCN1P35523 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CLCN1P35523 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms