Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC1P35052 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC1P35052 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC1P35052 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC1P35052 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC1P35052 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC1P35052 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC1P35052 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC1P35052 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC1P35052 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC1P35052 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC1P35052 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC1P35052 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC1P35052 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC1P35052 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC1P35052 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC1P35052 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC1P35052 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC1P35052 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC1P35052 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC1P35052 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC1P35052 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC1P35052 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC1P35052 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC1P35052 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC1P35052 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPC1P35052 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPC1P35052 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPC1P35052 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC1P35052 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC1P35052 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC1P35052 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC1P35052 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC1P35052 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC1P35052 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC1P35052 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC1P35052 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC1P35052 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC1P35052 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC1P35052 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC1P35052 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC1P35052 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC1P35052 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC1P35052 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC1P35052 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC1P35052 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC1P35052 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC1P35052 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC1P35052 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC1P35052 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC1P35052 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC1P35052 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC1P35052 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC1P35052 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC1P35052 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC1P35052 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC1P35052 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC1P35052 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC1P35052 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC1P35052 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC1P35052 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC1P35052 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC1P35052 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC1P35052 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC1P35052 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC1P35052 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC1P35052 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC1P35052 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC1P35052 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC1P35052 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC1P35052 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC1P35052 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC1P35052 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPC1P35052 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC1P35052 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC1P35052 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC1P35052 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC1P35052 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC1P35052 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC1P35052 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC1P35052 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC1P35052 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPC1P35052 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC1P35052 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC1P35052 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPC1P35052 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC1P35052 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC1P35052 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC1P35052 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC1P35052 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC1P35052 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC1P35052 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC1P35052 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC1P35052 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC1P35052 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC1P35052 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC1P35052 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC1P35052 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC1P35052 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC1P35052 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms