Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSP1P33241 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSP1P33241 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSP1P33241 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSP1P33241 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSP1P33241 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSP1P33241 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSP1P33241 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSP1P33241 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSP1P33241 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSP1P33241 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSP1P33241 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSP1P33241 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSP1P33241 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSP1P33241 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSP1P33241 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LSP1P33241 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSP1P33241 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSP1P33241 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSP1P33241 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSP1P33241 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSP1P33241 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSP1P33241 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LSP1P33241 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSP1P33241 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSP1P33241 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSP1P33241 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSP1P33241 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSP1P33241 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSP1P33241 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSP1P33241 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSP1P33241 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSP1P33241 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LSP1P33241 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSP1P33241 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSP1P33241 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LSP1P33241 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSP1P33241 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSP1P33241 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LSP1P33241 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSP1P33241 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LSP1P33241 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSP1P33241 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSP1P33241 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSP1P33241 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSP1P33241 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSP1P33241 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSP1P33241 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSP1P33241 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSP1P33241 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSP1P33241 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSP1P33241 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSP1P33241 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSP1P33241 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LSP1P33241 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSP1P33241 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSP1P33241 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSP1P33241 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSP1P33241 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSP1P33241 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSP1P33241 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSP1P33241 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSP1P33241 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSP1P33241 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSP1P33241 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSP1P33241 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSP1P33241 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSP1P33241 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSP1P33241 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSP1P33241 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSP1P33241 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSP1P33241 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSP1P33241 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LSP1P33241 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSP1P33241 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSP1P33241 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSP1P33241 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSP1P33241 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LSP1P33241 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSP1P33241 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSP1P33241 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSP1P33241 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSP1P33241 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSP1P33241 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LSP1P33241 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LSP1P33241 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LSP1P33241 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSP1P33241 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LSP1P33241 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LSP1P33241 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSP1P33241 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSP1P33241 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSP1P33241 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSP1P33241 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSP1P33241 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSP1P33241 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSP1P33241 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSP1P33241 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSP1P33241 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSP1P33241 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms