Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC8A1P32418 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8A1P32418 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC8A1P32418 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC8A1P32418 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms