Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB4P30926 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRNB4P30926 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB4P30926 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms