Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RBMS1P29558 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBMS1P29558 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBMS1P29558 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBMS1P29558 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms