Protein–RNA interactions for Protein: P24855

DNASE1, Deoxyribonuclease-1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1P24855 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNASE1P24855 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNASE1P24855 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNASE1P24855 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNASE1P24855 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNASE1P24855 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNASE1P24855 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNASE1P24855 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNASE1P24855 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNASE1P24855 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNASE1P24855 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNASE1P24855 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms