Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX1P22670 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX1P22670 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX1P22670 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RFX1P22670 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RFX1P22670 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX1P22670 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX1P22670 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX1P22670 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX1P22670 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX1P22670 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RFX1P22670 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFX1P22670 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFX1P22670 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RFX1P22670 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX1P22670 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX1P22670 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX1P22670 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX1P22670 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX1P22670 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RFX1P22670 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFX1P22670 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFX1P22670 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RFX1P22670 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RFX1P22670 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFX1P22670 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFX1P22670 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFX1P22670 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFX1P22670 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RFX1P22670 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFX1P22670 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFX1P22670 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFX1P22670 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RFX1P22670 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RFX1P22670 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RFX1P22670 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RFX1P22670 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RFX1P22670 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RFX1P22670 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RFX1P22670 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RFX1P22670 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RFX1P22670 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RFX1P22670 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RFX1P22670 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFX1P22670 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RFX1P22670 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFX1P22670 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFX1P22670 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFX1P22670 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RFX1P22670 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFX1P22670 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFX1P22670 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RFX1P22670 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RFX1P22670 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFX1P22670 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFX1P22670 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RFX1P22670 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RFX1P22670 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RFX1P22670 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFX1P22670 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFX1P22670 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RFX1P22670 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RFX1P22670 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFX1P22670 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFX1P22670 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RFX1P22670 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RFX1P22670 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFX1P22670 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFX1P22670 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RFX1P22670 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFX1P22670 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFX1P22670 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFX1P22670 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RFX1P22670 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFX1P22670 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFX1P22670 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFX1P22670 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFX1P22670 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFX1P22670 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFX1P22670 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFX1P22670 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFX1P22670 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFX1P22670 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFX1P22670 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RFX1P22670 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFX1P22670 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFX1P22670 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFX1P22670 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RFX1P22670 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RFX1P22670 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFX1P22670 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFX1P22670 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFX1P22670 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RFX1P22670 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFX1P22670 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFX1P22670 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFX1P22670 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFX1P22670 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RFX1P22670 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RFX1P22670 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms