Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERBB3P21860 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERBB3P21860 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERBB3P21860 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ERBB3P21860 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ERBB3P21860 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ERBB3P21860 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ERBB3P21860 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ERBB3P21860 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERBB3P21860 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ERBB3P21860 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERBB3P21860 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ERBB3P21860 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ERBB3P21860 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ERBB3P21860 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ERBB3P21860 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ERBB3P21860 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ERBB3P21860 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
ERBB3P21860 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ERBB3P21860 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ERBB3P21860 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ERBB3P21860 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ERBB3P21860 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ERBB3P21860 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ERBB3P21860 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ERBB3P21860 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ERBB3P21860 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ERBB3P21860 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ERBB3P21860 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ERBB3P21860 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ERBB3P21860 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ERBB3P21860 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ERBB3P21860 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ERBB3P21860 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ERBB3P21860 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ERBB3P21860 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.76■■■■□ 3
ERBB3P21860 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ERBB3P21860 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERBB3P21860 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERBB3P21860 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERBB3P21860 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERBB3P21860 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERBB3P21860 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERBB3P21860 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
ERBB3P21860 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERBB3P21860 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERBB3P21860 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERBB3P21860 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERBB3P21860 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERBB3P21860 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERBB3P21860 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERBB3P21860 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERBB3P21860 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERBB3P21860 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
ERBB3P21860 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ERBB3P21860 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms