Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL9A1P20849 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL9A1P20849 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL9A1P20849 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL9A1P20849 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL9A1P20849 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL9A1P20849 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL9A1P20849 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL9A1P20849 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
COL9A1P20849 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL9A1P20849 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
COL9A1P20849 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL9A1P20849 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL9A1P20849 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
COL9A1P20849 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL9A1P20849 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL9A1P20849 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
COL9A1P20849 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL9A1P20849 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms