Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCN1P20061 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCN1P20061 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCN1P20061 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCN1P20061 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCN1P20061 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCN1P20061 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCN1P20061 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCN1P20061 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCN1P20061 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCN1P20061 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCN1P20061 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCN1P20061 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCN1P20061 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCN1P20061 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCN1P20061 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCN1P20061 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCN1P20061 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCN1P20061 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCN1P20061 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCN1P20061 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCN1P20061 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCN1P20061 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TCN1P20061 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCN1P20061 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCN1P20061 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCN1P20061 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCN1P20061 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCN1P20061 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCN1P20061 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCN1P20061 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCN1P20061 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCN1P20061 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCN1P20061 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCN1P20061 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCN1P20061 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCN1P20061 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCN1P20061 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCN1P20061 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCN1P20061 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCN1P20061 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCN1P20061 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCN1P20061 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCN1P20061 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCN1P20061 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCN1P20061 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCN1P20061 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCN1P20061 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCN1P20061 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCN1P20061 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCN1P20061 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCN1P20061 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCN1P20061 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCN1P20061 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCN1P20061 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCN1P20061 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCN1P20061 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCN1P20061 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCN1P20061 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCN1P20061 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCN1P20061 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCN1P20061 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCN1P20061 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCN1P20061 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCN1P20061 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCN1P20061 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCN1P20061 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCN1P20061 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCN1P20061 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCN1P20061 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCN1P20061 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCN1P20061 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCN1P20061 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCN1P20061 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCN1P20061 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCN1P20061 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN1P20061 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN1P20061 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN1P20061 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN1P20061 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN1P20061 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN1P20061 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN1P20061 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN1P20061 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN1P20061 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN1P20061 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN1P20061 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCN1P20061 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCN1P20061 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TCN1P20061 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCN1P20061 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCN1P20061 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCN1P20061 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCN1P20061 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCN1P20061 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCN1P20061 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCN1P20061 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCN1P20061 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCN1P20061 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCN1P20061 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms