Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB6P18564 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB6P18564 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB6P18564 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB6P18564 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB6P18564 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB6P18564 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB6P18564 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB6P18564 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB6P18564 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB6P18564 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB6P18564 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB6P18564 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB6P18564 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB6P18564 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGB6P18564 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGB6P18564 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGB6P18564 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms