Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPA3P15088 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA3P15088 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA3P15088 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA3P15088 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA3P15088 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA3P15088 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA3P15088 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA3P15088 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CPA3P15088 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPA3P15088 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPA3P15088 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPA3P15088 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPA3P15088 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPA3P15088 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA3P15088 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA3P15088 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CPA3P15088 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA3P15088 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA3P15088 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPA3P15088 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA3P15088 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA3P15088 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA3P15088 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPA3P15088 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA3P15088 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA3P15088 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA3P15088 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPA3P15088 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA3P15088 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA3P15088 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA3P15088 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA3P15088 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPA3P15088 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA3P15088 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA3P15088 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA3P15088 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA3P15088 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPA3P15088 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA3P15088 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA3P15088 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA3P15088 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA3P15088 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA3P15088 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPA3P15088 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA3P15088 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA3P15088 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA3P15088 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA3P15088 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA3P15088 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA3P15088 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA3P15088 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA3P15088 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA3P15088 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CPA3P15088 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CPA3P15088 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CPA3P15088 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA3P15088 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA3P15088 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA3P15088 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA3P15088 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA3P15088 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA3P15088 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA3P15088 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA3P15088 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA3P15088 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA3P15088 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA3P15088 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA3P15088 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA3P15088 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA3P15088 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA3P15088 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA3P15088 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA3P15088 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA3P15088 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA3P15088 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPA3P15088 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPA3P15088 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPA3P15088 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPA3P15088 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPA3P15088 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CPA3P15088 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA3P15088 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA3P15088 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA3P15088 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA3P15088 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPA3P15088 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPA3P15088 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPA3P15088 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPA3P15088 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPA3P15088 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPA3P15088 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPA3P15088 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPA3P15088 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPA3P15088 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPA3P15088 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPA3P15088 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CPA3P15088 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPA3P15088 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPA3P15088 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms