Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BRAFP15056 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRAFP15056 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRAFP15056 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRAFP15056 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRAFP15056 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRAFP15056 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRAFP15056 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BRAFP15056 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BRAFP15056 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRAFP15056 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRAFP15056 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRAFP15056 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRAFP15056 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRAFP15056 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRAFP15056 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRAFP15056 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRAFP15056 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRAFP15056 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRAFP15056 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRAFP15056 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRAFP15056 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRAFP15056 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRAFP15056 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRAFP15056 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRAFP15056 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRAFP15056 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRAFP15056 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRAFP15056 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRAFP15056 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRAFP15056 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRAFP15056 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BRAFP15056 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRAFP15056 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRAFP15056 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRAFP15056 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRAFP15056 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRAFP15056 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRAFP15056 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAFP15056 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAFP15056 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAFP15056 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAFP15056 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAFP15056 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRAFP15056 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAFP15056 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAFP15056 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAFP15056 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRAFP15056 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRAFP15056 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRAFP15056 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRAFP15056 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
BRAFP15056 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRAFP15056 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRAFP15056 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRAFP15056 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAFP15056 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRAFP15056 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRAFP15056 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRAFP15056 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRAFP15056 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRAFP15056 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRAFP15056 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRAFP15056 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRAFP15056 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRAFP15056 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRAFP15056 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRAFP15056 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAFP15056 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAFP15056 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAFP15056 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAFP15056 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRAFP15056 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAFP15056 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAFP15056 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAFP15056 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAFP15056 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAFP15056 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAFP15056 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRAFP15056 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAFP15056 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAFP15056 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAFP15056 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAFP15056 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAFP15056 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRAFP15056 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRAFP15056 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRAFP15056 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRAFP15056 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BRAFP15056 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRAFP15056 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRAFP15056 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRAFP15056 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRAFP15056 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRAFP15056 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRAFP15056 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRAFP15056 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRAFP15056 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRAFP15056 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRAFP15056 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms