Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VCANP13611 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VCANP13611 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VCANP13611 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VCANP13611 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCANP13611 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VCANP13611 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCANP13611 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCANP13611 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VCANP13611 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VCANP13611 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VCANP13611 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCANP13611 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCANP13611 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCANP13611 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCANP13611 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCANP13611 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCANP13611 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCANP13611 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCANP13611 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCANP13611 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCANP13611 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCANP13611 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCANP13611 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCANP13611 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCANP13611 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VCANP13611 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VCANP13611 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
VCANP13611 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VCANP13611 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCANP13611 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCANP13611 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCANP13611 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCANP13611 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VCANP13611 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCANP13611 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCANP13611 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCANP13611 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCANP13611 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VCANP13611 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VCANP13611 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCANP13611 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCANP13611 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCANP13611 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCANP13611 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCANP13611 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCANP13611 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VCANP13611 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCANP13611 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCANP13611 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCANP13611 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCANP13611 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VCANP13611 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCANP13611 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCANP13611 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VCANP13611 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCANP13611 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCANP13611 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCANP13611 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCANP13611 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCANP13611 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCANP13611 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCANP13611 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCANP13611 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
VCANP13611 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCANP13611 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCANP13611 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCANP13611 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCANP13611 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
VCANP13611 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VCANP13611 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VCANP13611 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCANP13611 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCANP13611 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VCANP13611 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VCANP13611 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCANP13611 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCANP13611 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCANP13611 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCANP13611 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCANP13611 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCANP13611 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCANP13611 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCANP13611 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCANP13611 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCANP13611 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCANP13611 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCANP13611 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
VCANP13611 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
VCANP13611 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCANP13611 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCANP13611 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCANP13611 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCANP13611 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCANP13611 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCANP13611 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VCANP13611 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCANP13611 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCANP13611 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCANP13611 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms