Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
TOP2AP11388 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC45.13■■■■■ 4.82
TOP2AP11388 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
TOP2AP11388 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
TOP2AP11388 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.81
TOP2AP11388 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
TOP2AP11388 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
TOP2AP11388 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
TOP2AP11388 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
TOP2AP11388 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC45.09■■■■■ 4.81
TOP2AP11388 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
TOP2AP11388 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC45.08■■■■■ 4.81
TOP2AP11388 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
TOP2AP11388 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.81
TOP2AP11388 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.06■■■■■ 4.8
TOP2AP11388 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
TOP2AP11388 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
TOP2AP11388 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
TOP2AP11388 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
TOP2AP11388 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
TOP2AP11388 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
TOP2AP11388 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
TOP2AP11388 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
TOP2AP11388 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
TOP2AP11388 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
TOP2AP11388 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
TOP2AP11388 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
TOP2AP11388 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
TOP2AP11388 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
TOP2AP11388 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
TOP2AP11388 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC45.01■■■■■ 4.8
TOP2AP11388 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
TOP2AP11388 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
TOP2AP11388 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
TOP2AP11388 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
TOP2AP11388 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
TOP2AP11388 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC44.98■■■■■ 4.79
TOP2AP11388 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
TOP2AP11388 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
TOP2AP11388 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
TOP2AP11388 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
TOP2AP11388 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC44.96■■■■■ 4.79
TOP2AP11388 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC44.96■■■■■ 4.79
TOP2AP11388 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
TOP2AP11388 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC44.94■■■■■ 4.78
TOP2AP11388 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC44.94■■■■■ 4.78
TOP2AP11388 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC44.94■■■■■ 4.78
TOP2AP11388 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
TOP2AP11388 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
TOP2AP11388 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
TOP2AP11388 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC44.93■■■■■ 4.78
TOP2AP11388 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
TOP2AP11388 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
TOP2AP11388 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
TOP2AP11388 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
TOP2AP11388 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
TOP2AP11388 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
TOP2AP11388 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
TOP2AP11388 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
TOP2AP11388 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
TOP2AP11388 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
TOP2AP11388 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
TOP2AP11388 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
TOP2AP11388 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC44.87■■■■■ 4.77
TOP2AP11388 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
TOP2AP11388 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
TOP2AP11388 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
TOP2AP11388 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
TOP2AP11388 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
TOP2AP11388 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
TOP2AP11388 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC44.83■■■■■ 4.77
TOP2AP11388 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC44.82■■■■■ 4.77
TOP2AP11388 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC44.81■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.76
TOP2AP11388 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
TOP2AP11388 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
TOP2AP11388 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
TOP2AP11388 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
TOP2AP11388 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
TOP2AP11388 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC44.74■■■■■ 4.75
TOP2AP11388 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
TOP2AP11388 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
TOP2AP11388 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC44.73■■■■■ 4.75
TOP2AP11388 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms