Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OPN1MW3P0DN78 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
OPN1MW3P0DN78 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
OPN1MW3P0DN78 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms