Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RD3LP0DJH9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RD3LP0DJH9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RD3LP0DJH9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RD3LP0DJH9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RD3LP0DJH9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RD3LP0DJH9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RD3LP0DJH9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RD3LP0DJH9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RD3LP0DJH9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RD3LP0DJH9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RD3LP0DJH9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RD3LP0DJH9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms