Protein–RNA interactions for Protein: P0C8F1

PATE4, Prostate and testis expressed protein 4, humanhuman

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE4P0C8F1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATE4P0C8F1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATE4P0C8F1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PATE4P0C8F1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PATE4P0C8F1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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