Protein–RNA interactions for Protein: P06312

IGKV4-1, Immunoglobulin kappa variable 4-1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV4-1P06312 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGKV4-1P06312 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV4-1P06312 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV4-1P06312 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV4-1P06312 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV4-1P06312 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV4-1P06312 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV4-1P06312 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms