Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGF1P05230 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGF1P05230 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGF1P05230 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGF1P05230 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FGF1P05230 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGF1P05230 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FGF1P05230 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGF1P05230 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGF1P05230 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGF1P05230 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGF1P05230 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGF1P05230 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGF1P05230 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGF1P05230 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGF1P05230 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGF1P05230 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGF1P05230 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGF1P05230 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGF1P05230 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGF1P05230 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGF1P05230 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGF1P05230 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGF1P05230 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGF1P05230 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGF1P05230 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGF1P05230 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGF1P05230 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGF1P05230 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGF1P05230 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGF1P05230 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGF1P05230 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGF1P05230 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGF1P05230 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGF1P05230 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGF1P05230 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGF1P05230 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGF1P05230 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGF1P05230 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGF1P05230 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGF1P05230 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGF1P05230 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGF1P05230 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGF1P05230 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGF1P05230 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGF1P05230 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGF1P05230 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGF1P05230 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGF1P05230 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGF1P05230 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGF1P05230 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGF1P05230 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGF1P05230 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGF1P05230 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGF1P05230 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGF1P05230 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGF1P05230 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGF1P05230 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGF1P05230 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGF1P05230 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGF1P05230 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGF1P05230 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGF1P05230 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGF1P05230 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGF1P05230 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGF1P05230 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGF1P05230 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGF1P05230 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGF1P05230 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGF1P05230 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGF1P05230 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGF1P05230 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGF1P05230 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FGF1P05230 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGF1P05230 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGF1P05230 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGF1P05230 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGF1P05230 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGF1P05230 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGF1P05230 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGF1P05230 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGF1P05230 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGF1P05230 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGF1P05230 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGF1P05230 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGF1P05230 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGF1P05230 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGF1P05230 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGF1P05230 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGF1P05230 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGF1P05230 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGF1P05230 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGF1P05230 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGF1P05230 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGF1P05230 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGF1P05230 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGF1P05230 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGF1P05230 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGF1P05230 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGF1P05230 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms