Protein–RNA interactions for Protein: P04435

TCRB, T-cell receptor beta chain V region CTL-L17, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBP04435 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCRBP04435 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCRBP04435 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCRBP04435 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCRBP04435 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBP04435 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBP04435 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBP04435 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBP04435 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBP04435 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBP04435 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBP04435 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBP04435 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCRBP04435 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TCRBP04435 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCRBP04435 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCRBP04435 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCRBP04435 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCRBP04435 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBP04435 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBP04435 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBP04435 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBP04435 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBP04435 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBP04435 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBP04435 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCRBP04435 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCRBP04435 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCRBP04435 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBP04435 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBP04435 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBP04435 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBP04435 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCRBP04435 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCRBP04435 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCRBP04435 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TCRBP04435 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCRBP04435 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TCRBP04435 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCRBP04435 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCRBP04435 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCRBP04435 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCRBP04435 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCRBP04435 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCRBP04435 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCRBP04435 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCRBP04435 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TCRBP04435 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCRBP04435 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCRBP04435 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TCRBP04435 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TCRBP04435 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCRBP04435 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TCRBP04435 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TCRBP04435 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCRBP04435 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCRBP04435 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCRBP04435 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCRBP04435 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBP04435 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBP04435 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBP04435 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBP04435 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBP04435 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBP04435 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCRBP04435 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBP04435 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBP04435 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBP04435 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBP04435 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCRBP04435 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCRBP04435 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCRBP04435 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCRBP04435 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCRBP04435 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCRBP04435 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCRBP04435 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCRBP04435 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCRBP04435 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCRBP04435 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCRBP04435 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TCRBP04435 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TCRBP04435 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCRBP04435 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCRBP04435 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCRBP04435 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCRBP04435 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TCRBP04435 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCRBP04435 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCRBP04435 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCRBP04435 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TCRBP04435 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TCRBP04435 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCRBP04435 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCRBP04435 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCRBP04435 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCRBP04435 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCRBP04435 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCRBP04435 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCRBP04435 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms