Protein–RNA interactions for Protein: P04150

NR3C1, Glucocorticoid receptor, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR3C1P04150 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NR3C1P04150 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NR3C1P04150 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NR3C1P04150 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR3C1P04150 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR3C1P04150 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NR3C1P04150 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR3C1P04150 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR3C1P04150 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR3C1P04150 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR3C1P04150 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NR3C1P04150 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NR3C1P04150 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NR3C1P04150 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NR3C1P04150 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NR3C1P04150 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NR3C1P04150 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NR3C1P04150 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NR3C1P04150 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NR3C1P04150 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NR3C1P04150 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NR3C1P04150 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NR3C1P04150 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NR3C1P04150 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NR3C1P04150 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NR3C1P04150 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NR3C1P04150 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NR3C1P04150 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NR3C1P04150 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NR3C1P04150 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NR3C1P04150 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NR3C1P04150 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NR3C1P04150 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NR3C1P04150 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NR3C1P04150 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NR3C1P04150 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NR3C1P04150 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NR3C1P04150 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NR3C1P04150 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NR3C1P04150 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NR3C1P04150 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NR3C1P04150 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms