Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HLA-DRAP01903 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HLA-DRAP01903 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HLA-DRAP01903 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HLA-DRAP01903 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HLA-DRAP01903 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-DRAP01903 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HLA-DRAP01903 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HLA-DRAP01903 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HLA-DRAP01903 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms