Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IFNA21P01568 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFNA21P01568 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.3 ms