Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINA1P01009 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SERPINA1P01009 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERPINA1P01009 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINA1P01009 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPINA1P01009 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms