Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MBD3O95983 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MBD3O95983 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MBD3O95983 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MBD3O95983 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MBD3O95983 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MBD3O95983 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MBD3O95983 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MBD3O95983 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MBD3O95983 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MBD3O95983 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MBD3O95983 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MBD3O95983 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MBD3O95983 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MBD3O95983 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MBD3O95983 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MBD3O95983 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MBD3O95983 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MBD3O95983 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD3O95983 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD3O95983 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MBD3O95983 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD3O95983 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD3O95983 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MBD3O95983 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD3O95983 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD3O95983 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MBD3O95983 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD3O95983 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MBD3O95983 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD3O95983 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD3O95983 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD3O95983 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD3O95983 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD3O95983 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD3O95983 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD3O95983 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD3O95983 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MBD3O95983 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD3O95983 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD3O95983 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD3O95983 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD3O95983 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD3O95983 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MBD3O95983 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD3O95983 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD3O95983 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD3O95983 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD3O95983 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD3O95983 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD3O95983 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD3O95983 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD3O95983 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MBD3O95983 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MBD3O95983 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MBD3O95983 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD3O95983 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD3O95983 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD3O95983 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD3O95983 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD3O95983 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD3O95983 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD3O95983 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD3O95983 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD3O95983 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD3O95983 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD3O95983 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD3O95983 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD3O95983 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD3O95983 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD3O95983 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MBD3O95983 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MBD3O95983 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MBD3O95983 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MBD3O95983 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD3O95983 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD3O95983 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD3O95983 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MBD3O95983 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD3O95983 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD3O95983 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD3O95983 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MBD3O95983 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD3O95983 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD3O95983 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MBD3O95983 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD3O95983 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD3O95983 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD3O95983 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD3O95983 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MBD3O95983 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MBD3O95983 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MBD3O95983 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MBD3O95983 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MBD3O95983 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MBD3O95983 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MBD3O95983 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MBD3O95983 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MBD3O95983 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MBD3O95983 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms