Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL3O95573 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL3O95573 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACSL3O95573 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACSL3O95573 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACSL3O95573 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACSL3O95573 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACSL3O95573 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACSL3O95573 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACSL3O95573 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACSL3O95573 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACSL3O95573 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACSL3O95573 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACSL3O95573 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms