Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
RAPGEF3O95398 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
RAPGEF3O95398 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
RAPGEF3O95398 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
RAPGEF3O95398 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
RAPGEF3O95398 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
RAPGEF3O95398 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
RAPGEF3O95398 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
RAPGEF3O95398 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
RAPGEF3O95398 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
RAPGEF3O95398 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
RAPGEF3O95398 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
RAPGEF3O95398 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
RAPGEF3O95398 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
RAPGEF3O95398 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.8
RAPGEF3O95398 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
RAPGEF3O95398 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
RAPGEF3O95398 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
RAPGEF3O95398 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
RAPGEF3O95398 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
RAPGEF3O95398 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
RAPGEF3O95398 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
RAPGEF3O95398 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
RAPGEF3O95398 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
RAPGEF3O95398 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
RAPGEF3O95398 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
RAPGEF3O95398 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
RAPGEF3O95398 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
RAPGEF3O95398 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
RAPGEF3O95398 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
RAPGEF3O95398 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RAPGEF3O95398 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
RAPGEF3O95398 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
RAPGEF3O95398 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
RAPGEF3O95398 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
RAPGEF3O95398 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
RAPGEF3O95398 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
RAPGEF3O95398 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RAPGEF3O95398 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RAPGEF3O95398 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RAPGEF3O95398 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RAPGEF3O95398 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms