Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRATO95237 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRATO95237 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRATO95237 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRATO95237 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRATO95237 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRATO95237 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRATO95237 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRATO95237 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRATO95237 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRATO95237 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRATO95237 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRATO95237 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRATO95237 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRATO95237 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRATO95237 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRATO95237 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRATO95237 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRATO95237 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRATO95237 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRATO95237 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRATO95237 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRATO95237 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRATO95237 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRATO95237 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRATO95237 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRATO95237 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRATO95237 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRATO95237 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRATO95237 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRATO95237 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRATO95237 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRATO95237 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRATO95237 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRATO95237 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRATO95237 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRATO95237 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRATO95237 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRATO95237 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRATO95237 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRATO95237 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRATO95237 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRATO95237 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRATO95237 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRATO95237 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRATO95237 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRATO95237 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRATO95237 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRATO95237 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRATO95237 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRATO95237 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRATO95237 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRATO95237 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRATO95237 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LRATO95237 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRATO95237 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRATO95237 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRATO95237 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRATO95237 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRATO95237 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRATO95237 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRATO95237 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRATO95237 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRATO95237 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRATO95237 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRATO95237 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LRATO95237 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRATO95237 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRATO95237 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRATO95237 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRATO95237 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRATO95237 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRATO95237 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRATO95237 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRATO95237 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRATO95237 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRATO95237 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRATO95237 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRATO95237 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRATO95237 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRATO95237 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRATO95237 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRATO95237 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRATO95237 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRATO95237 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRATO95237 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRATO95237 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRATO95237 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRATO95237 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRATO95237 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRATO95237 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRATO95237 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRATO95237 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRATO95237 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRATO95237 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRATO95237 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRATO95237 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRATO95237 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRATO95237 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRATO95237 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms