Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL3O95236 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL3O95236 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL3O95236 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL3O95236 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOL3O95236 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL3O95236 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL3O95236 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL3O95236 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL3O95236 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL3O95236 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL3O95236 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOL3O95236 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL3O95236 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL3O95236 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL3O95236 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL3O95236 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOL3O95236 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL3O95236 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL3O95236 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL3O95236 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL3O95236 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL3O95236 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOL3O95236 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL3O95236 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOL3O95236 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL3O95236 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL3O95236 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL3O95236 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL3O95236 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL3O95236 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOL3O95236 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL3O95236 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL3O95236 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL3O95236 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOL3O95236 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL3O95236 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL3O95236 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL3O95236 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL3O95236 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOL3O95236 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL3O95236 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL3O95236 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL3O95236 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL3O95236 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL3O95236 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL3O95236 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOL3O95236 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL3O95236 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL3O95236 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL3O95236 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOL3O95236 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOL3O95236 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOL3O95236 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOL3O95236 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOL3O95236 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOL3O95236 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOL3O95236 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOL3O95236 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOL3O95236 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOL3O95236 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOL3O95236 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOL3O95236 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOL3O95236 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOL3O95236 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOL3O95236 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOL3O95236 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOL3O95236 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOL3O95236 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOL3O95236 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOL3O95236 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOL3O95236 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOL3O95236 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOL3O95236 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOL3O95236 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOL3O95236 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOL3O95236 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOL3O95236 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOL3O95236 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOL3O95236 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOL3O95236 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOL3O95236 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOL3O95236 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOL3O95236 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOL3O95236 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOL3O95236 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOL3O95236 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOL3O95236 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOL3O95236 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOL3O95236 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOL3O95236 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOL3O95236 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOL3O95236 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOL3O95236 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOL3O95236 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOL3O95236 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOL3O95236 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APOL3O95236 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOL3O95236 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOL3O95236 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms