Protein–RNA interactions for Protein: O95096

NKX2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-2O95096 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX2-2O95096 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX2-2O95096 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-2O95096 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKX2-2O95096 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms