Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF40AO75400 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PRPF40AO75400 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF40AO75400 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF40AO75400 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF40AO75400 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms