Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX3O75364 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX3O75364 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX3O75364 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PITX3O75364 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX3O75364 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PITX3O75364 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX3O75364 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX3O75364 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX3O75364 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX3O75364 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX3O75364 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PITX3O75364 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PITX3O75364 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX3O75364 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX3O75364 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX3O75364 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX3O75364 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX3O75364 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX3O75364 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX3O75364 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX3O75364 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX3O75364 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX3O75364 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX3O75364 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX3O75364 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX3O75364 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX3O75364 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX3O75364 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX3O75364 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX3O75364 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX3O75364 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX3O75364 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX3O75364 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX3O75364 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX3O75364 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX3O75364 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX3O75364 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX3O75364 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX3O75364 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX3O75364 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX3O75364 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITX3O75364 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX3O75364 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX3O75364 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX3O75364 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX3O75364 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX3O75364 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX3O75364 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX3O75364 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX3O75364 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX3O75364 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX3O75364 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX3O75364 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX3O75364 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX3O75364 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX3O75364 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX3O75364 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX3O75364 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX3O75364 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX3O75364 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX3O75364 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX3O75364 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX3O75364 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX3O75364 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX3O75364 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX3O75364 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX3O75364 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX3O75364 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX3O75364 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX3O75364 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITX3O75364 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX3O75364 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX3O75364 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX3O75364 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX3O75364 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX3O75364 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX3O75364 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX3O75364 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX3O75364 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX3O75364 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITX3O75364 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITX3O75364 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITX3O75364 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITX3O75364 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITX3O75364 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITX3O75364 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITX3O75364 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITX3O75364 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITX3O75364 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX3O75364 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX3O75364 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX3O75364 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX3O75364 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX3O75364 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX3O75364 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX3O75364 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITX3O75364 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITX3O75364 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITX3O75364 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms