Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF40O75150 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF40O75150 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF40O75150 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF40O75150 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF40O75150 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF40O75150 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF40O75150 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF40O75150 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF40O75150 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF40O75150 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF40O75150 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF40O75150 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF40O75150 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF40O75150 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF40O75150 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF40O75150 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF40O75150 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF40O75150 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF40O75150 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF40O75150 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF40O75150 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF40O75150 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF40O75150 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF40O75150 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF40O75150 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF40O75150 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF40O75150 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF40O75150 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF40O75150 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF40O75150 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF40O75150 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF40O75150 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF40O75150 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF40O75150 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF40O75150 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF40O75150 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF40O75150 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF40O75150 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF40O75150 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF40O75150 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF40O75150 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF40O75150 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF40O75150 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF40O75150 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF40O75150 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF40O75150 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF40O75150 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF40O75150 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF40O75150 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF40O75150 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF40O75150 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF40O75150 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF40O75150 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF40O75150 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF40O75150 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF40O75150 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF40O75150 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF40O75150 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF40O75150 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF40O75150 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF40O75150 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF40O75150 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF40O75150 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF40O75150 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF40O75150 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF40O75150 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF40O75150 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF40O75150 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF40O75150 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF40O75150 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF40O75150 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF40O75150 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF40O75150 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF40O75150 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF40O75150 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF40O75150 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF40O75150 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF40O75150 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF40O75150 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF40O75150 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF40O75150 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF40O75150 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF40O75150 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF40O75150 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF40O75150 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF40O75150 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF40O75150 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF40O75150 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF40O75150 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF40O75150 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF40O75150 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF40O75150 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF40O75150 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF40O75150 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF40O75150 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF40O75150 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF40O75150 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF40O75150 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF40O75150 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms