Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GDF9O60383 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDF9O60383 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF9O60383 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GDF9O60383 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF9O60383 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF9O60383 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GDF9O60383 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF9O60383 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF9O60383 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF9O60383 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF9O60383 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF9O60383 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDF9O60383 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF9O60383 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF9O60383 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF9O60383 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF9O60383 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDF9O60383 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF9O60383 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF9O60383 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDF9O60383 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF9O60383 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDF9O60383 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF9O60383 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF9O60383 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF9O60383 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDF9O60383 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF9O60383 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF9O60383 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDF9O60383 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF9O60383 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF9O60383 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF9O60383 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF9O60383 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF9O60383 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF9O60383 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDF9O60383 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF9O60383 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF9O60383 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF9O60383 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF9O60383 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF9O60383 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GDF9O60383 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF9O60383 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GDF9O60383 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF9O60383 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GDF9O60383 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF9O60383 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF9O60383 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF9O60383 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF9O60383 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF9O60383 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF9O60383 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GDF9O60383 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF9O60383 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF9O60383 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF9O60383 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF9O60383 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GDF9O60383 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF9O60383 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF9O60383 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF9O60383 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF9O60383 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF9O60383 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF9O60383 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF9O60383 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF9O60383 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF9O60383 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF9O60383 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF9O60383 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF9O60383 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF9O60383 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF9O60383 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF9O60383 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF9O60383 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF9O60383 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF9O60383 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF9O60383 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF9O60383 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF9O60383 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF9O60383 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF9O60383 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF9O60383 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF9O60383 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF9O60383 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF9O60383 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF9O60383 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF9O60383 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF9O60383 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF9O60383 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF9O60383 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF9O60383 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF9O60383 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF9O60383 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF9O60383 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF9O60383 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF9O60383 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF9O60383 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF9O60383 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms