Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AIREO43918 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AIREO43918 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AIREO43918 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AIREO43918 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AIREO43918 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AIREO43918 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AIREO43918 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AIREO43918 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AIREO43918 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AIREO43918 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AIREO43918 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIREO43918 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIREO43918 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIREO43918 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIREO43918 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AIREO43918 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AIREO43918 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AIREO43918 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AIREO43918 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AIREO43918 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AIREO43918 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIREO43918 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIREO43918 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIREO43918 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AIREO43918 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AIREO43918 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AIREO43918 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AIREO43918 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AIREO43918 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AIREO43918 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AIREO43918 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AIREO43918 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AIREO43918 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIREO43918 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIREO43918 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIREO43918 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AIREO43918 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AIREO43918 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AIREO43918 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AIREO43918 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AIREO43918 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AIREO43918 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AIREO43918 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AIREO43918 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AIREO43918 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AIREO43918 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AIREO43918 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AIREO43918 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AIREO43918 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AIREO43918 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AIREO43918 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AIREO43918 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AIREO43918 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AIREO43918 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AIREO43918 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIREO43918 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIREO43918 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIREO43918 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIREO43918 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AIREO43918 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AIREO43918 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AIREO43918 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AIREO43918 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AIREO43918 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AIREO43918 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIREO43918 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIREO43918 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIREO43918 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIREO43918 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIREO43918 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AIREO43918 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIREO43918 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIREO43918 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIREO43918 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AIREO43918 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIREO43918 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIREO43918 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIREO43918 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AIREO43918 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AIREO43918 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIREO43918 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIREO43918 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIREO43918 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AIREO43918 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIREO43918 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIREO43918 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIREO43918 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AIREO43918 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AIREO43918 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIREO43918 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIREO43918 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIREO43918 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIREO43918 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIREO43918 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIREO43918 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIREO43918 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AIREO43918 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AIREO43918 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AIREO43918 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms