Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
EXTL3O43909 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EXTL3O43909 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EXTL3O43909 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXTL3O43909 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXTL3O43909 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXTL3O43909 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EXTL3O43909 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXTL3O43909 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXTL3O43909 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EXTL3O43909 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EXTL3O43909 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EXTL3O43909 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EXTL3O43909 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EXTL3O43909 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXTL3O43909 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EXTL3O43909 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EXTL3O43909 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
EXTL3O43909 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXTL3O43909 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms