Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LANCL1O43813 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LANCL1O43813 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LANCL1O43813 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms