Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR1CO15160 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR1CO15160 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1CO15160 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1CO15160 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR1CO15160 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms