Protein–RNA interactions for Protein: O15119

TBX3, T-box transcription factor TBX3, humanhuman

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX3O15119 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TBX3O15119 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TBX3O15119 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TBX3O15119 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TBX3O15119 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TBX3O15119 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TBX3O15119 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TBX3O15119 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TBX3O15119 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TBX3O15119 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TBX3O15119 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TBX3O15119 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TBX3O15119 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TBX3O15119 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TBX3O15119 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBX3O15119 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBX3O15119 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBX3O15119 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBX3O15119 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBX3O15119 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBX3O15119 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBX3O15119 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBX3O15119 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBX3O15119 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TBX3O15119 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBX3O15119 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBX3O15119 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBX3O15119 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBX3O15119 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBX3O15119 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBX3O15119 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBX3O15119 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBX3O15119 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBX3O15119 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TBX3O15119 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBX3O15119 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBX3O15119 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBX3O15119 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TBX3O15119 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TBX3O15119 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TBX3O15119 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBX3O15119 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBX3O15119 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBX3O15119 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBX3O15119 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TBX3O15119 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TBX3O15119 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TBX3O15119 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBX3O15119 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBX3O15119 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBX3O15119 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TBX3O15119 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBX3O15119 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBX3O15119 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX3O15119 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX3O15119 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX3O15119 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX3O15119 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX3O15119 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX3O15119 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX3O15119 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX3O15119 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX3O15119 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX3O15119 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBX3O15119 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBX3O15119 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBX3O15119 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBX3O15119 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBX3O15119 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBX3O15119 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBX3O15119 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBX3O15119 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TBX3O15119 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBX3O15119 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TBX3O15119 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBX3O15119 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBX3O15119 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBX3O15119 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TBX3O15119 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TBX3O15119 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TBX3O15119 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TBX3O15119 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBX3O15119 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBX3O15119 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBX3O15119 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBX3O15119 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBX3O15119 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBX3O15119 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBX3O15119 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TBX3O15119 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TBX3O15119 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TBX3O15119 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TBX3O15119 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TBX3O15119 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TBX3O15119 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TBX3O15119 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TBX3O15119 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TBX3O15119 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TBX3O15119 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TBX3O15119 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms